Nature: 劉峰組合作研究首次揭示m6A甲基化修飾在造血幹細胞發育中的關鍵作用

  血液,是生命的源泉。不斷流動的血細胞既可以運輸營養物質,又是重要的免疫保護屏障。其中,所有的血細胞都來源於造血幹細胞。這群幹細胞不僅可以維持血液係統的長期穩定,也是骨髓移植治療惡性血液疾病的核心組分。目前,造血幹細胞來源仍是製約臨床惡性血液疾病治療的瓶頸。因此,造血幹細胞的體內發育和體外誘導擴增已成為當今科學界的熱點課題之一。 

  在脊椎動物中,造血幹細胞最初由特化的生血內皮通過內皮-造血轉化(EHT)過程產生於胚胎期主動脈-性腺-中腎區,隨後向胎肝(小鼠和人)或尾部造血組織(斑馬魚)遷移並進行擴增,向胸腺遷移以便發育為淋係細胞,最後,向骨髓(小鼠和人)或腎髓(斑馬魚)遷移以維持終生造血。經過幾十年的研究與探索,我們對於造血幹細胞的體內發育和體外誘導分化已有了基本的了解,但對整個過程的動態調控機製的認識仍不完善,尤其對於表觀遺傳修飾在脊椎動物造血幹細胞發育過程中的作用更是知之甚少。 

  m6AN6-甲基腺嘌呤)是最常見、最豐富的真核生物mRNA轉錄後修飾形式之一。該修飾過程是動態可逆的,並由甲基轉移酶複合體(METTL3WTAPMETTL14組成)、去甲基酶(FTOALKBH5)和相應的閱讀器(YTHDFYTHDC等)協同調控。目前,m6A的生物學功能已備受關注,並成為生命科學熱門研究領域之一,Nature雜誌連續發文報道了m6A在斑馬魚早期發育、果蠅性別決定以及T細胞穩態中的功能。自此,我們對於m6A修飾已經有了初步了解和認識,但是,該修飾的生物學功能以及其作用機製仍有待深入探索和挖掘。 

  必威精装版app西汉姆联 劉峰研究員領導的血液與心血管發育研究組長期以斑馬魚為模式生物研究造血幹細胞發育的分子調控機製。前期與北京基因組研究所楊運桂實驗室合作研究發現並鑒定了斑馬魚中的m6A甲基轉移酶複合體成分(Cell Res, 2014)。在此基礎上,研究人員通過m6A測序技術(m6A-Seq)發現,缺失m6A甲基轉移酶mettl3後,m6A在胚胎發育相關mRNA中的富集程度顯著下降。同時,在斑馬魚的血液-血管係統中,可檢測到mettl3的特異性表達。由此推測,m6A修飾與血液發育過程密切相關。係統的表型檢測顯示,在mettl3缺失的胚胎中,造血幹細胞不能正常產生,血管的內皮特性卻明顯增強,內皮-造血轉化過程受到阻斷。m6A-SeqRNA-Seq綜合分析發現,在mettl3缺失的胚胎中,一係列動脈內皮發育相關的基因,尤其是notch1am6A修飾水平顯著降低,而其mRNA水平卻顯著升高。上述結果證明,m6A修飾與EHT過程中內皮和造血基因表達的平衡調控相關。此外,YTHDF2-RIP-Seq和單堿基分辨率的m6A-miCLIP-Seq發現,m6A通過YTHDF2介導notch1a mRNA的穩定性,以維持EHT過程中內皮細胞和造血細胞基因表達的平衡,進而調控造血幹細胞的命運決定。上述結果在小鼠中也得到了驗證,證明m6A對造血幹細胞命運決定的調控在脊椎動物中是保守的。 

  該工作首次揭示m6A mRNA甲基化修飾在脊椎動物造血幹細胞命運決定中的調控機製,豐富了對m6A mRNA甲基化在正常生理狀態下的生物學功能的認識,是該研究領域的重大科研突破。上述成果不僅首次闡釋RNA的表觀修飾在血液發育中的關鍵作用,還將為體外誘導擴增造血幹細胞提供了理論指導。該文章“m6A modulates haematopoietic stem and progenitor cell specification”201796日正式發表於國際著名期刊NatureNature, September 6, 2017; doi: 10.1038/nature23883)。 

  必威精装版app西汉姆联 博士研究生張春霞、王璐副研究員,中國科學院基因組所博士生陳宇晟、孫寶發博士、楊瑩博士為共同第一作者,劉峰研究員和中國科學院基因組所楊運桂研究員為共同通訊作者。該課題得到了國家傑出青年科學基金、國家自然科學基金重點項目、國家重點基礎研究發展計劃和中科院幹細胞與再生醫學戰略性先導科技專項的資助。 (文章鏈接

  圖1m6A修飾調控造血幹細胞產生模式圖。甲基轉移酶Mettl3通過m6A修飾決定notch1amRNA水平,進而調控內皮-造血轉化過程。

2造血幹細胞通過內皮-造血轉換方式在主動脈血管底部產生。 該研究發現了新型的RNA甲基化修飾(紅色)通過調控造血發育重要基因Notch mRNA的穩定性,從而決定內皮細胞(綠色)轉變成造血幹細胞(藍色)。

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