劉山林，博士，研究員，博士生導師，必威精装版app西汉姆联 適應進化與生態互作研究組組長。入選中國科學院引才計劃。2007年和2010年分別在湖南師範大學動物學係獲得學士和碩士學位，2018年在丹麥哥本哈根大學自然曆史博物館獲得進化基因組學博士，2019 – 2023年期間在中國農業大學以博士後和副教授開展科研工作。長期從事動物多樣性形成及其全球變化應對相關研究，目前圍繞東方蜜蜂為代表的傳粉昆蟲展開工作。作為第一及通訊作者（含共同）在Cell,Nucleic Acid Research,Food Chemistry,Bioinformatics等期刊發表科研論文。論文總引用超過1萬次，個人H指數為41（穀歌學術），科睿唯安統計的全球高被引科學家之一。擔任Ecological entomology、Zoological Research: Diversity and Distribution期刊編委。

動物分子分類、保護基因組學、古基因組學、蜜蜂學

研究方向:

課題組主要圍繞傳粉昆蟲多樣性及其全球變化應對開展研究工作，通過分子分類、基因組學、古生物學等方法，進行野生動物資源的發現和科學分類，探討物種形成過程中的演化和適應機製，以及物種多樣性維持和生態服務功能等相關問題。將主要圍繞如下兩個方向開展研究工作：

1.物種多樣性快速鑒定新技術開發：利用DNA分子條形碼，結合高通量測序對混合樣品（“生物湯”）和環境DNA（eDNA）進行物種多樣性的快速鑒定，為物種的發現和科學分類提供技術支持，為進一步理解種間互作關係、物種多樣性應對全球變化的響應及其維持機製提供數據支持。

2.利用館藏曆史標本的係統發育和適應性演化研究：利用館藏標本所記錄曆史多樣性信息，通過與當代現生樣品的比較，結合組學大數據，解析生物類群的係統發育關係以及種內遺傳多樣性演變，在演化框架下探明全球變化影響下物種形成和瀕危過程中適應性演化機製，為進一步完善現代綜合演化理論提供遺傳基因組演化證據。

（*通訊作者）

動物進化方向：

Qiu L,Dong J,Li X,Parey SH,Tan K,Orr M,Majeed A,Zhang X,Luo S,Zhou X,Zhu C,Ji T,Niu Q,Liu S*,Zhou X. Defining honeybee subspecies in an evolutionary context warrants strategized conservation. Zool Res. 2023 May 18;44(3):483-493. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2022.414.

Liu S*,Westbury MV,Dussex N,Mitchell KJ,Sinding MS,Heintzman PD,Duchêne DA,Kapp JD,von Seth J,Heiniger H,Sánchez-Barreiro F,Margaryan A,André-Olsen R,De Cahsan B,Meng G,Yang C,et al. Ancient and modern genomes unravel the evolutionary history of the rhinoceros family. Cell. 2021 Sep 16;184(19):4874-4885.e16. doi: 10.1016/j.cell.2021.07.032.

van der Valk T,Pečnerová P,Díez-Del-Molino D,Bergström A,Oppenheimer J,Hartmann S,Xenikoudakis G,Thomas JA,Dehasque M,Sağlıcan E,Fidan FR,Barnes I,Liu S,Somel M,et al.,Million-year-old DNA sheds light on the genomic history of mammoths. Nature. 2021 Mar;591(7849):265-269. doi: 10.1038/s41586-021-03224-9.

Misof B*^#,Liu S^#,Meusemann K^#,Peters RS^#,Donath A^#,Mayer C^#,Frandsen PB^#,Ware J^#,Flouri T^#,Beutel RG^#,Niehuis O^#,Petersen M^#,Izquierdo-Carrasco F^#,Wappler T^#,Rust J^#,Aberer AJ,Aspöck U,Aspöck H,Bartel D,et al.,Phylogenomics resolves the timing and pattern of insect evolution. Science. 2014 Nov 7;346(6210):763-7. doi: 10.1126/science.1257570. (^#Major Contributors)

分子分類和生物信息方向：

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Lang D,Zhang S,Ren P,Liang F,Sun Z,Meng G,Tan Y,Li X,Lai Q,Han L,Wang D,Hu F,Wang W,Liu S*. Comparison of the two up-to-date sequencing technologies for genome assembly: HiFi reads of Pacific Biosciences Sequel II system and ultralong reads of Oxford Nanopore. Gigascience. 2020 Dec 15;9(12):giaa123. doi: 10.1093/gigascience/giaa123.

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Meng G,Li Y,Yang C,Liu S*. MitoZ: a toolkit for animal mitochondrial genome assembly,annotation and visualization. Nucleic Acids Res. 2019 Jun 20;47 (11):e63. doi: 10.1093/nar/gkz173

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