姓  名: 李 幸
學  科: RNA標記和調控
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簡曆介紹:

李幸,中國科學院動物所交叉科學中心研究員、博士生導師、研究組長。入選國家高層次青年人才計劃、中國科學院引才計劃。吉林大學和美國德克薩斯大學奧斯汀分校聯合培養博士,哈佛大學與麻省理工學院博德研究所(Broad Institute of Harvard and MIT)、康奈爾大學博士後。主持國家重點研發計劃課題、國家自然科學基金創新群體A類骨幹項目、國際交流合作項目、麵上項目等多項基金。

研究團隊專注於RNA生物學與化學的交叉領域,致力於開發RNA靶向小分子探針和藥物,結合RNA元件和CRISPR基因編輯等前沿生物技術,開展活細胞內核酸及關鍵代謝物的時空標記和藥物調控等研究。近五年以通訊作者(含共同)在Nature Communications(2024a, 2024b, 2025)JACS(2025)Angewandte Chemie (2021, 2023)Nucleic Acids Research(2023)等期刊發表多篇論文。擔任《中國生物物理學會》RNA治療學分會副秘書長,及Nature CommunicationsJACSAngewandte Chemie 等國際期刊審稿人。

研究領域:

1.RNA標記成像、傳感與化學調控

RNA是遺傳信息表達的傳遞者和重要調控者,已成為國際上發展最為迅速的生命科學研究熱點和前沿領域之一。RNA畸變造成生命功能失調,引發癌症、流行病、神經退行性疾病等一係列難治之症,如RNA病毒(SARS-CoV-2)的暴發流行,對人類生命健康和全球公共衛生安全構成了極大的挑戰和威脅。

我們研究組開展“RNA功能表征與化學幹預”研究:1)構建高性能的熒光RNA適配體及其靶向探針,實現原位、實時、高靈敏、單分子水平地追蹤RNA,解析體內RNA的時空信息和功能;2)重點關注人類疾病相關的畸變RNA,研發成藥性良好的RNA靶向小分子藥物,藥物幹預疾病RNA致病活性與功能;3)構築基於熒光RNA的生物傳感器,檢測人體內的小分子代謝物、蛋白質和離子,追蹤其生物合成動力學,解析其代謝調控機製和關鍵酶活性,構築高通量藥物篩選平台。

2. CRISPR合成生物學

對CRISPR進行合成生物學改造,可標記和調控細胞內源DNA/RNA的功能。我們開發基於CRISPR的染色體高分辨追蹤技術,時空原位地示蹤染色體轉錄、斷裂自修複、複製、有絲分裂等功能。此外,針對基因編輯CRISPR的生物安全問題,通過合成生物學手段引入光、小分子調控劑、RNA調控因子等,建立各類CRISPR調控技術,為有效防範基因編輯引發的生物安全風險提供理論基礎和工具方法。

3.小分子藥物與探針

小分子探針和藥物一直是創新藥領域的主要驅動力。基於靶標RNA和疾病的密切關聯,我們致力於研發RNA靶向的小分子探針、靶向降解劑、抑製劑等,描述小分子追蹤和幹預靶標RNA功能的表型和作用模式,促進RNA成藥性確證研究。此外,以昆蟲體內嗅覺受體蛋白作為靶標,研發靶向小分子信息素和調節劑,從而化學幹預嗅覺受體的功能,調控昆蟲聚/散行為,實現昆蟲災害的綠色預防和精準控製。

社會任職:

獲獎及榮譽:

承擔科研項目情況:

代表論著:

(*通訊作者;#共同第一作者)

  1. Chen, Z.#; Chen, W.#; Xu, C.#; Song, H.; Ji, X.; Jiang, H.; Duan, H.; Li, Z.; Gao, W.; Yao, T.; Zhang, Z.; He, L.; Yin, Y.; Yang, N.; Tian, W.; Wu, J.; Li, X.* Near-infrared fluorogenic RNA for in vivo imaging and sensing. Nature Communications (IF=16.6), 2025,16, 518.
  2. Chen, Z.#; Jiang, H.#; Yuan, L.; Yao, T.; Rong, X.; Gao, W.; Zeng, C.; He, L.; Yin, Y.; Jaffrey, S. R.; Zhao, F.; Zhang, J.; Xu, P.; Li, X.* Photoactivatable RNA Tags for Subcellular Photolabeling of RNA. Journal of the American Chemical Society (IF=15.6), 2025.
  3. Zhang, Z.#; Rong, X.#; Xie, T.; Song, H.; Li, Z.; Zhen, S.; Wu, J.; Jaffrey, S R. and Li, X.* Fluorogenic CRISPR for genomic DNA imaging. Nature Communications (IF=16.6), 2024, 15, 934.
  4. Zhang, Y.#; Xu, Z.#; Xiao, Y.#; Jiang, H.#; Zuo, X.; Li, X.* and Fang, X.* Structural mechanisms for binding and activation of a contact-quenched fluorophore by RhoBAST. Nature Communications (IF=16.6), 2024, 15, 4026. 
  5. Song, H.; Zhayila, R.; Fang, Y.; Jiang, H.; Hou, R.; Shi, Y.; Weng, Y.; Li, X.*; Liu, L.* RNA-Based Fluorescent Sensor with RhoBAST. Analytical Chemistry (IF=6.7), 2025, Jul 15.
  6. Hou, R.#; He, L.#; Ji, X.#; Rong, X.; Yin, Y.; Li, X.*; Weng, Y.*; Zhao, X.* Recent advances in fluorescent aptamer-based sensors for food safety analysis. Trends in Food Science & Technology (IF=15.1), 2025, 105023
  7. Gao, W.K., Chen, Z.Y., Rong, X.X., Li, X.* Progress in RNA dynamic imaging technology in live cells. Scientia Sinica Vitae, 2024, 54(4), 651-667.
  8. Chen, Z.; Chen, W.; Zhayila, R.; Jiang, H.; Wu, J.; and Li, X.* Genetically encoded RNA-based sensors with Pepper fluorogenic aptamer. Nucleic Acids Research (IF=14.9), 2023, 51 (16), 8322–8336.
  9. Chen, W.#; Zhao, X.#; Yang, N.*; Li, X.* Single mRNA Imaging with Fluorogenic RNA Aptamers and Small-molecule Fluorophores. Angewandte Chemie(IF=16.6), 2023, 62 (7), e202209813.
  10. Chen, Z.#; Duan, H.#; and Li, X.* In vivo single-molecule RNA structural profiling. Trends in Biochemical Sciences (IF=13.8), 2023, 48 (3), 211-212.
  11. Li, X.*; Wu, J.; Jaffrey, S. R.* Engineering Fluorophore Recycling in a Fluorogenic RNA Aptamer. Angewandte Chemie (IF=16.6), 2021, 60 (45), 24153-24161.
  12. Ma, K.; Li, X.*; Xu, B.; and Tian, W. Label-free bioassay with graphene oxide-based fluorescent aptasensors: A review. Analytica Chimica Acta (IF=6.911. Invited Review), 2021, 1188, 338859.

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